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    利用CRISPR/Cas9技术构建CTCF蛋白降解细胞系  CNKI文献

    CTCF是脊椎动物关键的绝缘子蛋白,在细胞生命过程中发挥重要作用,敲除CTCF基因会导致小鼠胚胎死亡。为进一步探讨CTCF的功能,本文利用CRISPR/Cas9介导的同源重组,在内源性CTCF表达框上游敲入一个有丝分裂期降解结构域...

    谢德健 师明磊... 《遗传》 2016年07期 期刊

    关键词: CRISPR/Cas9 / 基因组编辑 / CTCF / 蛋白质稳定性

    下载(288)| 被引(4)

    全基因组染色质相互作用Hi-C文库制备的优化及其质量控制  CNKI文献

    Hi-C(highest-throughput chromosome conformation capture)技术是近年出现的一种研究染色质相互作用的关键技术。该技术步骤多、耗时长,涉及的试剂耗材繁杂,目前常规流程还有较多可以改进优化的步骤。本研究以GM128...

    张香媛 何超... 《遗传》 2017年09期 期刊

    关键词: Hi-C技术 / 染色质相互作用 / 高通量测序

    下载(350)| 被引(3)

    核基质附着区广泛参与基因组三维结构折叠的生物信息学分析  CNKI文献

    在细胞分裂间期,每条染色质都占据着特定的染色质领域(chromosome territory,CT)。每个CT领域内进一步分成不同的拓扑学相关区域(topological associated domain,TAD),每个TAD又由若干子TAD(sub-TAD)构成。不同的TAD相...

    何超 李平... 《中国生物化学与分子生物学报》 2017年06期 期刊

    关键词: 核基质附着区 / 染色质三维结构 / 生物信息学 / 多组学分析

    下载(148)| 被引(1)

    Alu元件在染色质三维结构层次上的生物信息学分析  CNKI文献

    染色质在细胞核内三维高级结构包括最底层的核小体、核小体组成的"串珠"结构、螺线管纤维结构、染色质/DNA环结构(chromatin/DNA loop)、拓扑结构域(topologically associated domain, TAD)等多层次结构。其...

    何超 沈文龙... 《遗传》 2019年03期 期刊

    关键词: 染色质三维结构 / Alu元件 / 生物信息 / 进化树

    下载(65)| 被引(0)

    单染色体靶向富集方法的建立  CNKI文献

    靶向富集技术具有良好的均一性、特异性和灵敏性,只需较低的测序覆盖度即可满足后续的分析。该技术被广泛应用于特定位点重测序和染色体构象等研究。为了靶向富集测序文库中特定的染色体DNA片段,本研究以21号染色体为...

    谢德健 张田甜... 《中国生物化学与分子生物学报》 2016年09期 期刊

    关键词: 多重退火环形扩增 / 高通量测序 / 靶向富集 / 单染色体

    下载(86)| 被引(0)

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