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    定点突变提高青霉素G酰化酶的稳定性  CNKI文献

    以大肠杆菌青霉素G酰化酶的晶体结构为模板 ,用软件PMODELING同源模建巨大芽孢杆菌青霉素G酰化酶的三维结构。在此基础上 ,将 β亚基 4 2 7位 (突变A)和 4 3 0位 (突变B)赖氨酸残基突变为丙氨酸 ,降低了该酶的等电点 ...

    杨晟 黄鹤... 《生物化学与生物物理学报》 2000年06期 期刊

    关键词: 青霉素G酰化酶 / 定点突变 / 稳定性

    下载(250)| 被引(28)

    蛋白质功能基团三维模体及其应用  CNKI文献

    用一维序列模体和三维结构模体刻画与识别蛋白质功能区是蛋白质功能预测和分子设计中的重要课题.目前三维模体的提取与搜索均以残基为单位进行,特异性有限.鉴于残基的功能基团才是其发挥功能的关键要素,提出以功能...

    叶玉珍 解涛... 《科学通报》 2000年12期 期刊

    关键词: 功能基因三维模体 / 距离矩阵均方根偏差 / 概率 / 期望值

    下载(211)| 被引(11)

    蛋白质与类药分子的柔性对接  CNKI文献

    本文利用“禁忌搜索”算法和Gehlhaar简化能量势函数实现蛋白质与类药分子之间的柔性对接。对包含100个复合物的检验集进行了计算检验,得到了满意的结果,89%预测复合物结构的误差小于0.25nm。与...

    汤海旭 叶玉珍... 《生物化学与生物物理学报》 1998年06期 期刊

    关键词: 类药分子 / 柔性对接 / 禁忌搜索 / Gehlhaar势函数

    下载(217)| 被引(8)

    用嫁接活性位点方法设计新的功能蛋白质  CNKI文献

    将一个蛋白质的活性位点,嫁接到另一个分子量较小但是稳定的蛋白质(骨架蛋白)上,从而形成一种新的功能蛋白质,这是蛋白质设计中一种很有效的方法。在我们发展的异型自洽系综最优化方法(heteroSCEO)...

    叶玉珍 汤海旭... 《生物化学与生物物理学报》 1999年03期 期刊

    关键词: 功能蛋白质设计 / 位点嫁接 / 异型自洽系综最优化方法 / 3D-模体搜索

    下载(99)| 被引(6)

    蛋白质骨架库的构建及其在功能蛋白质设计中的应用  CNKI文献

    利用活性位点嫁接设计新的功能蛋白质的方法需要功能模体和蛋白质骨架两种构件。出于活性位点嫁接的需要,我们构建了一个蛋白质骨架库,且提供搜索与功能模体相配骨架的工具及其评估方法。并用两个活性位点的嫁接进行...

    叶玉珍 丁达夫 《生物物理学报》 1999年04期 期刊

    关键词: 活性位点嫁接 / 蛋白质骨架库 / 接触势能 / 适配

    下载(106)| 被引(1)

    蛋白质核心设计的序列组合文库筛选方法  CNKI文献

    本文提出一种新的蛋白质序列组合文库筛选方法,异型自洽系综最优法(hetero-SCEO,heterogeneousself-consistentensembleoptimization),用于从头设计...

    叶玉珍 汤海旭... 《生物化学与生物物理学报》 1998年05期 期刊

    用自洽系综最优法预测溶剂化蛋白质突变体的结构  CNKI文献

    ChristopheLee等发展的自洽系综最优化方法(self-consistentensembleoptimization,SCEO),在预测核内残基突变体的结构中取得了很好的效果。我们在Lee的基...

    叶玉珍 汤海旭... 《生物物理学报》 1998年02期 期刊

    关键词: 自洽系综最优化方法(SCEO) / 平均场能 / 构象抽样 / 溶剂化效应

    下载(23)| 被引(1)

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