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    基于质谱的选择反应监测技术相关策略和方法的研究进展  CNKI文献

    随着蛋白质组学研究的不断深入,基于质谱的选择反应监测技术(SRM)已经成为以发现生物标志物为代表的定向蛋白质组学研究的重要手段.SRM技术根据假设信息,特异性地获取符合假设条件的质谱信号,去除不符合条件的离子信号...

    常乘 吴松锋... 《生物化学与生物物理进展》 2012年11期 期刊

    关键词: 定向蛋白质组学 / 生物质谱 / 选择反应监测技术 / 蛋白质特异性肽段

    下载(519)| 被引(16)

    转录组与蛋白质组比较研究进展  CNKI文献

    转录组和蛋白质组比较研究发现,总体而言其间的相关性不高. 根据数据的类型不同可以将现有的研究分为4类:单点比较、两点差异比较、多点时序比较和多点非时序比较. 对其差异原因的研究和分析表明:除了由实验系统及数据...

    吴松锋 朱云平... 《生物化学与生物物理进展》 2005年02期 期刊

    关键词: 转录组 / 蛋白质组 / 相关性 / 翻译调控

    下载(3289)| 被引(72)

    基于质谱技术筛选差异表达蛋白的统计学策略研究进展  CNKI文献

    随着质谱技术的快速发展,蛋白质组学已成为继基因组学、转录组学之后的又一研究热点,寻找可靠的差异表达蛋白对于生物标记物的发现至关重要.因此,如何准确、灵敏地筛选出差异蛋白已成为基于质谱的定量蛋白质组学的主要...

    王锦霞 常乘... 《中国科学:生命科学》 2015年04期 期刊

    关键词: 质谱 / 蛋白质组学 / 差异表达蛋白 / 统计学原理

    下载(359)| 被引(2)

    蛋白质组学研究中的无标记定量方法  CNKI文献

    蛋白质定量是探索疾病发生发展状况和寻找新药靶标的重要手段.该领域最常用的技术是比较染色后的二维凝胶上蛋白点的光密度值或综合同位素标记后的质谱峰强度方法.但此二者的样品处理方法都比较麻烦,不利于进行大规模...

    薛晓芳 吴松锋... 《中国生物化学与分子生物学报》 2006年06期 期刊

    关键词: 无标记蛋白定量 / 质谱数 / 峰强度

    下载(940)| 被引(18)

    利用串联质谱鉴定氨基酸突变的生物信息学算法  CNKI文献

    氨基酸突变能够改变蛋白的结构和功能,影响生物体的生命过程.基于串联质谱的鸟枪法蛋白质组学是目前大规模研究蛋白质组学的主要方法,但是现有的质谱数据鉴定流程为了提高鉴定结果的灵敏度往往会有意压缩数据库中的氨...

    余庆 吴松锋... 《中国科学:生命科学》 2014年11期 期刊

    关键词: 氨基酸突变 / 串联质谱 / 鸟枪法蛋白质组学 / 氨基酸突变鉴定

    下载(211)| 被引(2)

    用EM算法改进鸟枪法蛋白质鉴定中的无标记定量方法  CNKI文献

    蛋白质定量是探索疾病发生发展状况和寻找新药靶标的重要手段。在shotgun蛋白组学中,目前常用定量方法包括综合同位素标记后的质谱峰强度方法和无标记定量方法。根据数据类型无标记定量方法可以分为两类:基于鉴定蛋白...

    薛晓芳 吴松锋... 《分析化学》 2007年01期 期刊

    关键词: EM算法 / 鸟枪法 / 蛋白无标记定量 / 质谱数

    下载(372)| 被引(13)

    基于PC/Linux的核酸序列分析系统的构建及其应用  CNKI文献

    基于PC机和Linux操作系统 ,利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件 ,构建了核酸序列大规模自动分析系统 .该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性...

    张成岗 欧阳曙光... 《生物化学与生物物理进展》 2001年02期 期刊

    关键词: PC机 / Linux操作系统 / Phred/Phrap/Consed软件 / Blast软件

    下载(397)| 被引(32)

    非限制翻译后修饰鉴定方法的研究进展  CNKI文献

    蛋白质翻译后修饰在真核生物细胞内广泛存在,对蛋白质的结构和功能有着十分重要的影响.串联质谱技术的快速发展为翻译后修饰鉴定提供了高通量、高灵敏度和高分辨率的分析平台,但传统搜索引擎鉴定修饰的方法无法满足数...

    张成普 李宁... 《生物化学与生物物理进展》 2013年04期 期刊

    关键词: 串联质谱 / 蛋白质翻译后修饰 / 生物信息学 / 蛋白质组学

    下载(320)| 被引(1)

    人类蛋白质组表达谱蛋白质鉴定的分步搜索策略  CNKI文献

    大规模蛋白质组表达谱研究的蛋白质鉴定一般采取基于数据库搜索的策略,因此数据库的选择及搜索策略在蛋白质鉴定中非常重要。现有的人类蛋白质数据库远不够完善,而从其他物种的蛋白质数据库中所能得到的补充非常有限,...

    吴松锋 朱云平... 《遗传》 2005年05期 期刊

    关键词: 蛋白质组 / 蛋白质鉴定 / 蛋白质数据库 / 质谱

    下载(377)| 被引(11)

    SARS-CoV及其他冠状病毒基因组比较分析  CNKI文献

    对病毒种内和种间基因组的比较分析能获得很多关于病毒起源与演化的信息。对17株SARS-CoV的种内基因组变异分析发现共有137个变异位点,估算出SARS-CoV的突变率为8.04×10~(-3)核苷酸替换/位点/年。变异位点在基因...

    吴松锋 杜春娟... 《遗传》 2003年04期 期刊

    关键词: 严重急性呼吸系统综合征(SARS) / 冠状病毒 / 多态

    下载(200)| 被引(9)

    22周孕龄人胎肝表达序列标签数据更新与初步分析  CNKI文献

    随着国际上转录组数据及本室22周孕龄人胎肝表达序列标签数据的不断增加,先前该组织表达谱的研究有必要进行更新与完善.本研究首先将22周孕龄人胎肝每一表达序列标签与自身数据库,UniGene,DoTS,MGC以及Twinscan预测的...

    陈廷贵 吴松锋... 《科学通报》 2008年18期 期刊

    关键词: 人胎肝 / 表达序列标签 / 归类与拼接 / 基因本体论

    下载(75)| 被引(0)

    22周孕龄胎肝蛋白质相互作用网络的构建  CNKI文献

    目的:建立在胎肝中存在的蛋白质相互作用的网络以及其中与造血的相互作用和通路。方法:利用多个蛋白质数据库以及邻域基因法、基因融合法、种系发生谱法等三种生物信息学方法,相互补充,相互验证。结果:从数据库中得到...

    程钢 吴松锋... 中国蛋白质组学首届学术大会论文摘要集 2003-09-01 中国会议

    关键词: 胎肝 / 蛋白质

    下载(33)| 被引(0)

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