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Gaussian软件在红外光谱学教学中的应用  CNKI文献

探讨了Gaussian软件在红外光谱学教学中的具体应用,帮助学生在课堂上对分子的三维空间结构、振动光谱的理解、振动模式的指认与归属等方面有更加感性的认识,从而提高课堂趣味性,使得教学内容更为形象生动。

蔡开聪 杜芬芬... 《化学教育》 2014年08期 期刊

关键词: Gaussian软件 / 红外光谱 / 分子结构 / 振动形式

下载(360)| 被引(14)

甘氨酸二肽分子酰胺-Ⅰ带光谱与结构相关性  CNKI文献

系统探索了蛋白质二肽模型分子——甘氨酸二肽(GLYD)在气相与水溶液中的结构与光谱特性。从分子动力学轨迹中提取具有代表性结构的GLYD-D_2O聚集体的瞬态结构开展简正模式分析,获取了对蛋白质二级结构敏感的酰胺-Ⅰ带...

蔡开聪 郑轩... 《物理化学学报》 2016年05期 期刊

关键词: 甘氨酸二肽 / 酰胺-Ⅰ带 / 振动光谱 / 静电频率图

下载(86)| 被引(2)

丙氨酸二肽分子二级结构与振动光谱特性  CNKI文献

利用从头算方法探索蛋白质模型分子——丙氨酸二肽的二级结构布居特性以及体系势能变化.引入对分子结构敏感的振动探针(酰胺振动吸收带),借助其光谱表象,寻求振动光谱参数与分子结构之间的联系.研究结果表明:丙氨酸二...

蔡开聪 留珊红... 《物理化学学报》 2012年08期 期刊

关键词: 从头算 / 丙氨酸二肽 / 振动光谱 / 酰胺-Ⅰ带

下载(143)| 被引(4)

乙醇醛的分子动态结构  CNKI文献

以量子化学计算作为起点,为最简单的糖类分子——乙醇醛开发了两套分子力学力场参数:基于肽类的力场和基于醛类的力场.分子动力学模拟结果表明,所开发的类醛力场参数能够较好地描述乙醇醛分子在水中的结构以及水分子在...

蔡开聪 王建平 《物理化学学报》 2009年04期 期刊

关键词: 力场参数 / 分子动力学模拟 / 红外光谱

下载(221)| 被引(2)

振动探针用于丙氨酸二肽在氯仿溶剂中的结构研究  CNKI文献

利用从头算方法探索蛋白质模型分子——丙氨酸二肽在氯仿溶剂环境下的二级结构布居特征.借助对分子结构敏感的振动探针(酰胺振动吸收带)的光谱表象,寻求振动光谱参数与分子结构之间的联系.研究结果表明,丙氨酸二肽分子...

蔡开聪 杜芬芬... 《福建师范大学学报(自然科学版)》 2014年03期 期刊

关键词: 从头算 / 丙氨酸二肽 / 氯仿溶剂 / 振动光谱

下载(44)| 被引(0)

Discovery Studio软件在生物化学教学中的应用——分子的刚...  CNKI文献

借助Discovery Studio(简称:DS)软件,探讨了分子对接中的刚性对接在课堂教学中的运用,促使学生对配体与受体间相互作用机制及其强弱关系有更感性的认识,进而提高课堂教学质量。同时,有利于学生在课后自行练习,深化对分...

侯彦君 蔡开聪 《化学教育(中英文)》 2019年02期 期刊

关键词: Discovery / Studio软件 / 分子对接 / 刚性对接

下载(474)| 被引(0)

β(1→4)糖苷键振动光谱与纤维二糖结构的相关性研究  CNKI文献

选取了β(1→4)糖苷键作为结构探针,在B3LYP/6-31+G(d)水平上比较了真空环境及在离子液体1-丁基-3-甲基咪唑氯盐(C4mimCl)中的纤维二糖的特征振动光谱参数,建立起糖苷键振动频率与纤维二糖结构之间的相关性。研究结果...

刘佳 蔡开聪 《光谱学与光谱分析》 2016年S1期 期刊

关键词: 纤维二糖 / 糖苷键 / 振动光谱

下载(88)| 被引(0)

丙氨酸二肽的酰胺-Ⅰ带振动频率图  CNKI文献

基于分子力学力场构建了丙氨酸二肽(ALAD)在重水溶剂中的酰胺-Ⅰ带振动频率图,将溶剂作用以静电势场的形式投影至ALAD分子骨架中,并且引入骨架二面角对酰胺-Ⅰ带的影响,实现处于不同构象态的ALAD中酰胺-Ⅰ带光谱的快速...

郑轩 蔡开聪 《光谱学与光谱分析》 2016年S1期 期刊

关键词: 丙氨酸二肽 / 振动频率图 / 酰胺-Ⅰ带 / 二级结构

下载(37)| 被引(0)

连续进样一体式免拆卸的红外液体样品池  CNKI文献

设计了一种固定光程的可自动连续进样的一体式免拆卸红外液体样品池,可用于液体样品的红外光谱测定,尤其适用于易挥发、接触角小等以传统液膜法难以制样的液体样品,并采用微型蠕动泵对样品进行连续进样从而实现红外光...

郑荣珍 蔡开聪 《光谱学与光谱分析》 2016年S1期 期刊

关键词: 红外液体样品池 / 连续进样 / 红外光谱 / 免拆卸

下载(56)| 被引(0)

赖氨酸二肽二级结构与振动光谱特性研究  CNKI文献

利用量子化学方法,在B3LYP/6-31+G(d)水平上系统考察气相中赖氨酸二肽(lysine dipeptide,LYSD)分子骨架上对二级结构敏感的振动探针——酰胺-I带的振动光谱。通过势能分布(potential energy distribution,PED)分析方法...

庄丹玲 蔡开聪 《光谱学与光谱分析》 2016年S1期 期刊

关键词: 赖氨酸二肽 / 振动光谱 / 酰胺-Ⅰ带 / 二级结构

下载(50)| 被引(1)

天冬酰胺二肽分子的酰胺-Ⅰ带与二级结构相关性  CNKI文献

借助对结构敏感的振动探针(酰胺-Ⅰ带)探索天冬酰胺二肽在气相中结构与光谱特征的相关性。研究结果表明,天冬酰胺二肽处于不同构象时振动光谱参数表现出了显著的差异,酰胺-Ⅰ带吸收峰的频率、峰宽对多肽二级结构表现出...

严思仪 蔡开聪 《光谱学与光谱分析》 2016年S1期 期刊

关键词: 天冬酰胺二肽 / 酰胺-Ⅰ带 / 振动光谱 / 二级结构

下载(34)| 被引(0)

炔丙基修饰的甘氨酸二肽的振动光谱研究  CNKI文献

选取了炔丙基作为多肽二级结构探针,模拟炔丙基修饰的甘氨酸二肽在水溶液中的结构动力学特性,构建炔丙基甘氨酸二肽中炔丙基的振动频率图,实现对其振动光谱的快速预测,进一步建立了炔丙基的振动光谱与多肽二级结构之间...

郑荣珍 蔡开聪 《光谱学与光谱分析》 2016年S1期 期刊

关键词: 炔丙基 / 振动光谱 / 二级结构 / 多肽

下载(26)| 被引(0)

肉眼看微观世界:VMD软件在蛋白质结构教学中的应用  CNKI文献

主要探讨了VMD软件作为一个高效的可视化工具在蛋白质三维结构教学中的应用。它帮助学生用一种更加直观、立体且富于互动的方式认识蛋白质分子不同的折叠方式及其二级结构特性。借助VMD软件还能对处于不停热运动中的分...

郑荣珍 严思仪... 《化学教育》 2016年12期 期刊

关键词: VMD软件 / 二级结构 / 蛋白质 / 可视化

下载(162)| 被引(4)

氮乙酰葡萄糖胺分子结构及振动光谱相关性研究  CNKI文献

探究氮乙酰葡萄糖胺(N-acetyl-D-glucosamine,NAG)分子的稳定结构及其红外振动光谱之间的相关性,致力于解析出蕴含在光谱信息中的分子构象特征.研究表明,当NAG分子中乙酰胺基发生构象异构使得羰基与相邻羟基处于同一平...

杜娟 侯彦君... 《福建师范大学学报(自然科学版)》 2019年02期 期刊

关键词: 氮乙酰葡萄糖胺 / 红外光谱 / 构象 / 氢键

下载(68)| 被引(2)

Gaussian软件在红外光谱教学中的应用——溶剂效应  CNKI文献

借助Gaussian软件帮助学生认识溶剂环境对分子特征基团振动光谱的影响,并以氮甲基乙酰胺和乙腈分子为例,在不同溶剂环境中进行分子结构的优化与红外光谱预测。研究结果表明,不同极性的溶剂与体系相互作用不同,使得分子...

刘佳 庄丹玲... 《化学教育(中英文)》 2018年10期 期刊

关键词: Gaussian软件 / 溶剂效应 / 红外光谱 / 光谱频移

下载(168)| 被引(1)

Gaussian软件在红外光谱教学中的应用——同位素效应  CNKI文献

借助Gaussian软件探讨了同位素效应对分子特征官能团红外光谱的影响,帮助学生在课堂上认识同位素取代可能造成的红外特征吸收峰的光谱频移,并进一步促进学生在课后独立思考,发挥主观能动性,自行设计有效的同位素取代方...

侯彦君 庄丹玲... 《化学教育(中英文)》 2017年24期 期刊

关键词: Gaussian软件 / 同位素效应 / 红外光谱 / 光谱频移

下载(110)| 被引(1)

纤维二糖在离子液体1-丁基-3-甲基咪唑氯盐中的结构动力学特...  CNKI文献

开展分子动力学模拟探索不同压力条件下纤维素的基本结构单元——纤维二糖在离子液体1-丁基-3-甲基咪唑氯盐([C_4mim]Cl)中的结构动力学特征。研究结果表明,高压环境使二糖分子内氢键网络结构瓦解,二糖与阴阳离子间相...

刘佳 杜芬芬... 《化工学报》 2016年S2期 期刊

关键词: 纤维二糖 / 离子液体 / 分子模拟 / 压力

下载(68)| 被引(0)

淀粉样蛋白片段结构动力学与酰胺-Ⅰ带振动光谱示踪  CNKI文献

借助分子对接方法,获取了β淀粉样蛋白(Amyloidβprotein,Aβ)的核心片段Aβ25-35与乙酰胆碱受体相互作用的最优结合构象,并在此基础上开展结合后的复合物的分子动力学模拟,探索其结构动力学特征。将构建的氨基酸多肽...

侯彦君 郑轩... 《光谱学与光谱分析》 2018年S1期 期刊

关键词: β淀粉样蛋白 / 乙酰胆碱受体 / 酰胺-Ⅰ带频率图 / 结构动力学

下载(63)| 被引(0)

两种倍他司汀类药物分子结构与药理特性研究  CNKI文献

人体前庭外周器官受损,会导致眩晕、恶心、呕吐等症状,这些症状通常会逐渐减轻,这一自然恢复的过程称为前庭代偿~1。组胺(HIS)是参与前庭代偿的重要递质之一,是G蛋白偶联受体H_1的弱激动剂,G蛋白偶联受体H_3的强拮抗剂...

侯彦君 蔡开聪 中国化学会第14届全国计算(机)化学学术会议暨分子模拟国际论... 2017-11-17 国际会议

关键词: 倍他司汀类药物 / G蛋白偶联受体 / 分子对接 / 量子化学计算

下载(14)| 被引(0)

叠氮振动吸收带对多肽二级结构的敏感性研究  CNKI文献

利用从头算方法系统研究了叠氮基振动吸收带对β-叠氮丙氨酸二肽二级结构的敏感性。研究结果表明,处于不同构象的β-叠氮丙氨酸二肽分子,其叠氮基振动吸收带的振动频率有着明显的差异。在天然氨基酸侧链引入叠氮基,将...

蔡开聪 刘亚男 第十八届全国分子光谱学学术会议论文集 2014-10-31 中国会议

关键词: 从头算 / β-叠氮丙氨酸二肽 / 红外光谱 / 叠氮基

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