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多重序列比对Alignment的信息度量准则  CNKI文献

多重序列的比对(Alignment)的核心问题是对多重DNA(或RNA、蛋白质)序列,寻找它们的相似部分或稳定区域,但如何定义多重序列的相似度(或罚分函数)则是解决多重序列比对的前提。首先对多重序列相似度的合理性进行了讨论...

沈世镒 《工程数学学报》 2002年04期 期刊

氨基酸在蛋白质空间结构中的深度倾向性因子  CNKI文献

用统计和几何方法给出了氨基酸在蛋白质空间结构中的深度计算,并利用PDB数据库得到了不同氨基酸在蛋白质中的深度倾向性因子,并得到了这些倾向性因子与氨基酸的物理、化学综合特性的相关性质.

沈世镒 胡刚... 《生物数学学报》 2007年02期 期刊

原核生物基因组的CDS与ORF序列的几点分析  CNKI文献

基因组的开放阅读框(ORF)是基因识别与基因组分析的基础,有多种软件包给出了它们的生成算法,但结果与指标并不统一.本文给出了po-MORF的定义与它的生成算法,证明了由基因组所确定的po-MORF集合的存在与唯一性,并由该生...

沈世镒 高建召... 《生物数学学报》 2009年01期 期刊

关键词: 基因组的p_0-MORF序列 / MORF生成算法 / CDS与ORF序列集合的相互关系

下载(275)| 被引(0)

蛋白质二级结构的条件隐Markov性及其预测问题  CNKI文献

蛋白质二级结构预测问题自1957年首次被提出迄今已有40多年了,从知道的文献中可以得出如下信息:在统计意义之下,蛋白质序列中氨基酸之间的相互作用较弱,所以,统计方法中所依赖的独立性假设虽然不是从物理背景中得来的...

沈世镒 阮吉寿 《工程数学学报》 2003年03期 期刊

蛋白质空间形态特征分析与计算方法  CNKI文献

本文的主要目的是把空间多面体、超图与深度这三个概念综合起来,作为描述与分析空间质点系形态的基本工具。在此基础上,我们针对蛋白质空间形态中的二种重要特征: “空洞”与“口袋”,用小球滚动法给出它们的计算方法...

沈世镒 胡刚... 《工程数学学报》 2006年02期 期刊

关键词: 空间多面体 / 超图 / 质点系的形态分析与小球滚动法

下载(112)| 被引(3)

黄芪注射液的临床应用现状  CNKI文献

目的 :介绍黄芪注射液临床应用现状 ,为临床用药提供参考。方法 :对国内近年来的相关文献进行分析、归纳。结果 :黄芪是治疗多种疾病的有效药物 ,已广泛用于临床。结论 :黄芪具有增强心肌收缩力 ,抗病毒 ,清除体内氧自...

沈世镒 王建中... 《中药药理与临床》 2002年03期 期刊

关键词: 黄芪注射液 / 临床应用

下载(139)| 被引(9)

关于多重序列比对距离矩阵的一点注记  CNKI文献

因为多重序列比对的最优解问题是一个非易计算问题,所以在生物信息学中,对多重序列分析常常采用两两序列比对来实现。因此由两两比对所产生的距离矩阵在多重序列比对分析中起重要作用。证明了由两两序列比对所产生的距...

沈世镒 《工程数学学报》 2003年03期 期刊

时间离散Hopfield神经网络系统的若干问题  CNKI文献

如果一个Hopfield神经网络系统(以下简记为HNNS)是时间离散、状态连续的,就称之为时间离散的HNNS(以下简记为TD-HNNS).对这种系统,如果在它的算子的作用下,状态的能量函数具有固定的增...

沈世镒 《高校应用数学学报A辑(中文版)》 1999年01期 期刊

关于Shannon熵的统计计算及其在分布检验中的应用  CNKI文献

本文利用顺序统计量给出了一个关于经验分布的定义,由这个定义可以给出关于连续型分布的Shannon熵的估计量,我们证明了它们的一系列收敛性,利用Shannon熵的统计量及最大熵原理,我们给出了一个关于正态分布,指数分布,均...

沈世镒 《高校应用数学学报A辑(中文版)》 1988年04期 期刊

关键词: 分布密度 / 定义 / 正态分布 / Gauss

下载(154)| 被引(5)

一般罚分(或得分)矩阵下的SPA算法  CNKI文献

本文在一般罚分(或得分)矩阵条件下推广SPA(Super Pairwise Alignment)算法,该算法是一种次优算法,与Smith-Waterman算法比较,计算速度有明显改进(计算复杂度随序列长度线性增长).

沈世镒 张拓... 《应用数学》 2007年03期 期刊

关键词: 一般罚分(或得分)矩阵 / SPA算法 / 线性复杂度

下载(125)| 被引(1)

生物序列的语义分析与第二密码规则的探索  CNKI文献

生物序列(如DNA、RNA与蛋白质一级结构序列等)都是由一系列小分子团(如核苷酸、氨基酸等)排列组成,如把这些小分子团作为符号单元,那么这些生物序列就是生物序列就是生物学的语言文字,对这些语言文字的结构分析为生物...

沈世镒 《工程数学学报》 2004年05期 期刊

关于《信息论》的若干新方向  CNKI文献

Ⅰ.引言 信息论从1948年C.E.Shannon的奠基性论支发表以来,至今已有37年了,37年来,它经历了一系列的发展阶段,目前已成为一门内容丰富,与近代信息工程,信息化密切相关的基础性科学。尤其是近年来,它的一系列新兴分支的...

沈世镒 《数学进展》 1988年04期 期刊

关键词: 信息论 / 算法 / 计算机科学 / 编码理论

下载(201)| 被引(2)

DNA计算中突变误差的纠正  CNKI文献

文章重点讨论了在DNA计算中突变误差的处理问题,其中包括突变误差的数据空间、突变误差的自动纠正和纠错码在DNA操作系统设计中的应用问题。并在分析突变误差数据空间、突变误差纠错码的基础上,提出了解决DNA计算中突...

沈世镒 张拓 《计算机工程与应用》 2006年07期 期刊

关键词: DNA计算 / 广义纠错码 / 突变误差的自动纠正 / DNA操作系统设计

下载(121)| 被引(2)

生物序列的语义分析与第二密码规则的探索(续)  CNKI文献

本文继续讨论蛋白质一级结构序列的语义结构,利用组合分析与图论方法讨论 Swiss - Prot 数据 库的组合结构,给出 Swiss - Prot 数据库中蛋白质一级结构序列的关键词与核心词的定义、搜索 算法与特性参数。并由此...

沈世镒 余涛... 《工程数学学报》 2004年06期 期刊

一般离散序列模型信源编码定理  CNKI文献

1.引言 信源编码问题是Shannon信息论中的一个重要问题,近几年来,对这个问题有一系列重要结果,无论在理论上与实际应用上都有一定的意义。对该问题的确切提法与若干重要结果已由C.E.Shannon,R.G.Gallager,T.Berger文阐...

沈世镒 《数学年刊A辑(中文版)》 1980年02期 期刊

关键词: 序列模型 / 连续状态 / 编码定理 / 信源编码

下载(112)| 被引(3)

Shannon定理中信息准則成立的充要条件  CNKI文献

本文是在胡国定先生的[1]文基础上写出的,主要討論了信源序列的結构性貭,信息准則(B)成立的充要条件及准則(B)与概率准則(A)的关系. 准則(A),(B)实际上就是Shannon第一定理及第二定理.本文主要推广了在一般条件下及临...

沈世镒 《数学学报》 1962年04期 期刊

关键词: 信源 / 定理 / Shannon / 序列

下载(71)| 被引(5)

多重序列突变网络系统分析与应用  CNKI文献

为分析多重生物序列的突变结构,首先是要作它们的多重比对,在多重比对基础上可作出各序列的系统树与最小距离树,在最小距离树中如果把它们的弧用突变模结构来表示,那么我们称由此所产生的数学模型为多重序列突变网络系...

沈世镒 胡刚... 《工程数学学报》 2006年04期 期刊

关键词: 多重序列突变网络系统 / 突变网络的正交化理论 / SARS序列分析

下载(62)| 被引(0)

相似序列Alignment快速算法及其应用  CNKI文献

本文综述近期得到的由相似核苷酸序列给出Alignm ent的快速算法,以及此算法在若干应用问题中得到的新结果.

沈世镒 《南开大学学报(自然科学版)》 1999年03期 期刊

关键词: 生物信息学 / 相似的核苷酸序列 / Alignment快速算法

下载(92)| 被引(2)

论信息科学  CNKI文献

“信息”,这是个很时髦的词,几乎到处使用,但一是,信息科学的内容是什么?它目前的状况和将来的发展又如何?恐怕就未必为许多人所知了.《论信息科学》一文严格而又明确地阐述了有关的内容,颇具参考价值。

沈世镒 《自然杂志》 1986年11期 期刊

关键词: 信息论 / 概率 / 算法

下载(90)| 被引(2)

一般多路通讯网络系统信息传输的基本定理  CNKI文献

1.引言 多路通讯问题是Shannon信息论在近几年内获得迅速发展的一个重要分支,它以快速通讯系统网络化,卫星通讯网与广播电视卫星网为背景而建立的信息传输模型,[1]文综合介绍了1962—1977年内有关工作的进展情况,从这...

沈世镒 《数学年刊A辑(中文版)》 1981年01期 期刊

关键词: 无记忆性 / 充要条件 / 专线 / 联合分布

下载(44)| 被引(4)

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