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嗜热菌耐热性与蛋白质序列、结构和功能关系的生物信息学研...  CNKI文献

嗜热菌产生的耐热酶在研究酶进化、蛋白质耐热的分子机制及酶功能上限温度等方面具有极其重要的理论和应用价值。研究蛋白质的序列、结构和功能对嗜热菌耐热性的影响作用,不仅可以从理论角度描述蛋白质折叠和稳定背后...

丁彦蕊 导师:须文波 江南大学 2005-06-01 博士论文

关键词: NCBI / COG数据库 / 古细菌类蛋白质 / 细菌类蛋白质

下载(1765)| 被引(12)

氢键与蛋白质耐热性关系的研究  CNKI文献

挑选了NCBI COG数据库中具有全基因组的单细胞微生物,选择其中已知三维结构的蛋白质作为研究对象,通过HB- Plus3.0计算出氢键数目并用Perl编程将氢键分类,研究了不同类型的氢键对蛋白质耐热性的影响。结果表明:随着耐...

丁彦蕊 蔡宇杰... 《计算机与应用化学》 2007年05期 期刊

关键词: 蛋白质 / 耐热性 / 氢键

下载(426)| 被引(20)

蛋白质空间结构属性与全基因组微生物耐热性的关系  CNKI文献

溶剂接触表面积、空腔个数和体积、紧密度、疏水性以及温度因子是影响蛋白质耐热的主要三维结构参数.挑选NCBI COG数据库中具有全基因组的单细胞微生物,选择其中三维结构已知的蛋白质作为研究对象,分析这些因素对细菌...

丁彦蕊 蔡宇杰... 《中国生物化学与分子生物学报》 2007年04期 期刊

关键词: 空间结构属性 / 全基因组 / 耐热性

下载(232)| 被引(13)

用同源建模法探索提高脂肪酶的耐热性  CNKI文献

分析常温脂肪酶和耐热蛋白质结构的差异,确定影响脂肪酶耐热性的关键氨基酸为Glu,Lys,Ala,Asp,Thr和Gln;继而重构常温脂肪酶的分子,并利用支持向量机分类器预测其耐热性;再用同源建模法模型化。比较重构前后的分子发现...

丁彦蕊 蔡宇杰... 《计算机与应用化学》 2007年11期 期刊

关键词: 脂肪酶 / 耐热性 / 同源建模 / 盐桥

下载(322)| 被引(8)

氨基酸组成对蛋白质耐热性的影响  CNKI文献

为了研究一级结构对蛋白质耐热性的影响 ,利用软件DNAMAN对 16个家族 32种蛋白质序列进行了氨基酸含量分析 ,并统计分析了氨基酸组成对蛋白质耐热性的影响。通过比较同一家族的高低温蛋白质序列及 16个家族中所有高温...

丁彦蕊 蔡宇杰... 《生物技术》 2004年04期 期刊

关键词: 蛋白质 / 氨基酸 / 耐热性 / 统计分析

下载(288)| 被引(15)

盐桥与全基因组微生物耐热性的关系研究  CNKI文献

挑选了NCBI COG数据库中具有全基因组的单细胞微生物,选择其中三维结构已知的蛋白质作为研究对象,研究了盐桥数目和类型对古细菌和细菌类蛋白质耐热性的影响作用。结果表明:无论古细菌还是细菌类蛋白质,总盐桥含量和盐...

丁彦蕊 蔡宇杰... 《华中农业大学学报》 2007年03期 期刊

关键词: 全基因组 / 蛋白质 / 耐热性 / 盐桥

下载(196)| 被引(8)

离子交换法提取青霉素G的探索  CNKI文献

研究了5种性能不同的树脂对青霉素G提取的影响,确定了非极性大孔吸附树脂为适合青霉素G吸附的树脂。同时采用正交实验设计研究了上柱青霉素G浓度,吸附流量,洗脱剂种类等因素的影响作用,从而确定了提取青霉素G的最佳条...

丁彦蕊 蔡宇杰... 《离子交换与吸附》 2003年01期 期刊

关键词: 青霉素G / 离子交换法 / 动态 / 法碘量法

下载(323)| 被引(5)

糖醇工业中的色谱分离技术  CNKI文献

本文论述了色谱分离技术在糖醇工业中的应用情况。并对模拟移动床色谱技术在糖醇工业中的发展和应用特点,以及作者在这方面的工作进行了详细介绍。

丁彦蕊 蔡宇杰... 《中国食品添加剂》 2002年02期 期刊

关键词: 色谱 / 糖醇 / 分离 / 模拟移动床

下载(346)| 被引(5)

基于氨基酸组成预测蛋白质热稳定性的v-支持向量机方法(英文...  CNKI文献

支持向量机有许多优点:有效防止过拟和,适合大的特征空间,给定数据集的信息压缩。本文首次利用支持向量机从氨基酸组成来预测蛋白质的稳定性。总预测率可以达到80.64%,对嗜热蛋白质的预测率为82.50%,对嗜温蛋白质的预...

丁彦蕊 蔡宇杰... 《计算机与应用化学》 2005年06期 期刊

关键词: v-支持向量机 / 蛋白质热稳定性 / 嗜热蛋白质 / 嗜温蛋白质

下载(146)| 被引(6)

基于SVM和KNN的蛋白质耐热性分类  CNKI文献

以氨基酸含量为特征向量,研究了SVM和KNN预测蛋白质耐热性的准确度。结果表明,基于SVM的分类效果较好,其局部预测率和全局预测率分别为82.4%和83.4%;而基于KNN方法的局部预测率和全局预测率分别为77.6%和79.9%。两种方...

丁彦蕊 蔡宇杰... 《计算机工程与应用》 2007年16期 期刊

关键词: 氨基酸含量 / SVMKNN / 蛋白质耐热性

下载(138)| 被引(7)

青霉素G阴离子态的稳定性影响因素研究  CNKI文献

采用化学动力学的方法 ,研究了温度、缓冲液 pH对青霉素G阴离子态的稳定性的影响 ,线性回归得到青霉素G阴离子态时降解速率常数 ,验证了青霉素在水溶液中的降解反应服从一级动力学模型lnC/C0 =-kt ;非线性拟合求得log...

丁彦蕊 蔡宇杰... 《中国抗生素杂志》 2003年01期 期刊

关键词: 青霉素G阴离子 / 稳定性 / 温度 / 缓冲液pH

下载(180)| 被引(10)

蛋白质耐热性及其在食品中应用的研究进展  CNKI文献

耐热蛋白质是一类能够在高温下保持活性并发挥作用的蛋白质,阐明蛋白质的耐热机理不仅可以解释蛋白质的折叠过程、搞清蛋白质结构与功能的关系,而且可以为设计耐高温的新型酶类提供理论依据。影响蛋白质耐热的因素很多...

丁彦蕊 蔡宇杰... 《食品与机械》 2006年06期 期刊

关键词: 蛋白质 / 耐热性 / 氢键 / 盐桥

下载(280)| 被引(3)

计算机专业生物信息学课程教学的实践探讨  CNKI文献

介绍了生物信息学课程教学的特点,分析了计算机专业生物学课程教学中存在的问题,提出了计算机专业生物信息学课程教学方法。

丁彦蕊 蔡宇杰 《安徽农业科学》 2012年29期 期刊

关键词: 生物信息学 / 计算机专业 / 教学方法 / 多学科交叉

下载(92)| 被引(5)

BP和概率神经网络预测微生物热稳定性的比较  CNKI文献

微生物的热稳定性与代谢网络的拓扑特征之间存在着密切的关系。分析了460个微生物的22个代谢网络拓扑特征,分别利用BP神经网络和概率神经网络建立分类模型,以比较两种算法预测微生物热稳定性的效果。通过分析隐层数目...

丁彦蕊 徐星宇... 《江南大学学报(自然科学版)》 2012年06期 期刊

关键词: BP神经网络 / 概率神经网络 / 代谢网络拓扑特征 / 热稳定性预测

下载(71)| 被引(2)

系统发育与古细菌Val-tRNA合成酶耐热性的关系  CNKI文献

嗜热古细菌和常温古细菌的氨基酰-tRNA合成酶在生物合成蛋白质中都起着至关重要的作用,它们的功能相似而耐热性相差很大。为了阐明氨基酰-tRNA合成酶的耐热机制,本文从进化角度研究了具有全基因组的8种超高温古细菌、...

丁彦蕊 李成渊... 《计算机与应用化学》 2010年04期 期刊

关键词: Val-tRNA合成酶 / 系统发育法 / 耐热性

下载(141)| 被引(1)

二级结构组件与蛋白质耐热性的关系研究  CNKI文献

挑选了NCBI COG数据库中具有全基因组的单细胞微生物,选择其中三维结构已知的蛋白质作为研究对象,研究了不同类型的二级结构含量和长度对古细菌和细菌类蛋白质耐热性的影响作用。结果表明:耐热的古细菌类蛋白质中含有...

丁彦蕊 蔡宇杰... 《生物信息学》 2007年03期 期刊

关键词: 蛋白质 / 耐热性 / 二级结构

下载(148)| 被引(4)

贝叶斯方法在蛋白质耐热性分类中的研究  CNKI文献

氨基酸含量是影响蛋白质耐热性的主要因素。本文以氨基酸含量为特征向量,研究了贝叶斯方法预测蛋白质耐热性的准确度。结果表明,基于贝叶斯方法的局部预测率和全局预测率分别为73.1%和76.1%。这不仅表明贝叶斯方法适合...

丁彦蕊 蔡宇杰... 《微计算机信息》 2007年07期 期刊

关键词: 氨基酸含量 / 贝叶斯 / 蛋白质耐热性

下载(161)| 被引(3)

超氧化物歧化酶氨基酸网络的鲁棒性研究  CNKI文献

蛋白质结构的鲁棒性能够提高蛋白质在不稳定环境中保持生物功能的能力。用氨基酸网络表示超氧化物歧化酶(Fe-SOD)的结构,从研究氨基酸网络鲁棒性的角度研究Fe-SOD结构的鲁棒性。实验结果显示,氨基酸网络的鲁棒性比同等...

丁彦蕊 王雪芹... 《计算机与应用化学》 2014年09期 期刊

关键词: Fe-SOD / 氨基酸网络 / 鲁棒性 / 热稳定性

下载(49)| 被引(1)

基于支持向量机的太湖入湖河流水质影响因素的研究  CNKI文献

以影响太湖入湖河流水质的23个因素值为研究对象,通过分析这些因素值随时间的变化趋势,发现随时间变化较大的因素为TN,CODMn,TP,石油类,Cd和Pb;以这些因素值为特征向量,利用支持向量机对轻度污染水质和重度污染水质进...

丁彦蕊 孙小妹... 《水资源与水工程学报》 2011年05期 期刊

关键词: 支持向量机 / 影响因素 / 水体水质

下载(100)| 被引(0)

十二烷基键合固定相的制备及在青霉素降解研究中的应用  CNKI文献

采用 2 ,4 -戊二酮与正十二烷基二甲基氯硅烷在咪唑的催化下制成活泼的中间体——硅醚烷基中间体 ,再与硅胶进行键合 ,用元素分析法测得该固定相中 C的质量分数为 9.6 8%。利用该固定相 ,在流动相为乙腈 -0 .0 2 m ol...

丁彦蕊 蔡宇杰... 《中国医药工业杂志》 2002年12期 期刊

关键词: 固定相 / 高效液相色谱 / 青霉素G / 降解产物

下载(78)| 被引(3)

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